染色质免疫沉淀(ChIP)是一种广泛使用的实验技术,用于监测蛋白质与特定DNA序列的关联。该技术已用于研究组蛋白修饰的模式,并借助微阵列技术,在全基因组范围内绘制各种蛋白质的结合位点。ChIP还已用于确定多种蛋白质占据特定染色质基因座的时间调控。另外,由于甲醛有效地将蛋白与DNA交联,并将蛋白与蛋白交联,因此该方法原则上可以检测直接结合DNA的蛋白质以及通过其他因素间接结合DNA的蛋白质。 在进行ChIP时,需要将来自细胞和组织的染色质片段化,以使其变得可溶,并且可以在检测特定位点的蛋白质-DNA相互作用时实现分辨率。超声处理是生产剪切染色质的常用方法。尽管此方法在将染色质释放到溶液中非常有效,但它有许多局限性。 例如,与超声处理相关的泡沫和过热可能导致蛋白变性或染色质不完全断裂。 同样,超声处理条件可能在物理上很苛刻,并且可能对免疫沉淀效率产生负面影响。 该程序中的这些和其他限制会使样品超声处理难以优化和可重复执行。 EZ-Zyme染色质制备试剂盒通过使用专有的酶混合物进行完全或部分消化,获得平均长度为一到几个核小体的染色质片段,从而可以对核小体分辨率进行ChIP分析。 与超声处理相比,该程序不仅可以以较高的分辨率绘制蛋白质-DNA关系图,而且由于其温和的消化条件,使随后的免疫沉淀更加有效。此外,酶切与非交联ChIP(天然ChIP)兼容,这不仅可以分析培养细胞上的组蛋白修饰,还可以分析新鲜解剖和冷冻的组织上的组蛋白修饰。用途:EZ-Zyme试剂盒包含优化的试剂,可从哺乳动物细胞生成酶促处理的染色质,用于染色质免疫沉淀。尽管该试剂盒包含染色质剪切所需的完整缓冲液,但必须注意说明的详细信息。 仔细遵循全部说明,尤其是关于孵育时间和温度。
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