通过离心分离法收集过夜的重组大肠杆菌培养液，然后通过改性SDS 碱裂解法进行处理。通过离心分离法收集细菌细胞，然后在含有RNase的重悬溶液中进行重悬。之后，裂解细胞并通过加入结合溶液使细胞变性。随后将制备的裂解液转移到在真空歧管中装配的Sigma HP滤板上进行过滤，然后收集到一个深孔板中。此真空歧管经过重新布置，过滤后的裂解液转移到Sigma HP结合反应板上。质粒DNA被捕获到硅胶膜上，杂质则通过连续的洗涤步骤去除掉。最后，对结合反应板进行干燥，并在洗脱溶液中洗脱质粒DNA。
GenElute HP 96孔质粒小量制备试剂盒为从重组大肠杆菌培养物中高通量纯化质粒DNA提供了一种简单、快速、低成本的解决方案。该试剂盒结合了硅胶结合技术和真空形式的便利性，可在50分钟内从1.3 mL的培养物中回收出至多10 μg高拷贝数质粒DNA。实际的得率和最佳的培养物体积取决于所用的质粒和培养基。
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